Текущее время: 12 дек 2019, 07:17




Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 178 ]  На страницу Пред.  1 ... 8, 9, 10, 11, 12  След.
 Волновая Генетика и ДНК Человека 
Автор Сообщение
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 22 май 2009, 00:24
Сообщения: 13477
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека




09 апр 2010, 23:56
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
27 апреля 2010 г.Норберт Лоссау | Die Welt

В никотиновой зависимости виновны гены

Возникновение привычки к табакокурению во многом связано с социальным окружением человека. Но почему тогда не каждый становится заядлым курильщиком? Почему зависимость проявляется по-разному? До сих пор, пишет немецкая Die Welt, было принято пенять на печень. Но авторы исследования, в ходе которого были проанализированы данные 41 тыс. человек, считают иначе.

Опираясь на статистику, эксперты утверждают, что 9 из 10 случаев рака легких связаны с курением. Исключения из правил - когда 90-летние курильщики чувствуют себя превосходно, а раком легких заболевают представители более молодого поколения, не страдающие никотиновой зависимостью, - ученые объясняют теперь наличием определенных изменений в генах. Так, в ходе исследований удалось установить, что повышенный риск заболеть раком легких есть у людей с изменением в 15-й хромосоме.

В научном журнале "Nature Genetics", продолжает автор, было опубликовано три исследования, в которых команда международных ученых под руководством экспертов из Оксфордского университета рассказала о связи между генетической диспозицией и склонностью к курению. Так, исследовав данные 41 тыс. человек, ученые пришли к выводу, что мутации 8-й и 19-й хромосом приводят к тому, что человек более склонен к табачной зависимости. Помимо этого, люди с подобными генными мутациями выкуривают больше сигарет в день, в результате чего увеличивается риск развития рака легких. При этом прогноз ученых звучит еще более мрачно: у носителей таких мутированных генов риск заболеть раком легких выше даже при менее активном курении.

"Обнаружение этой закономерности повышает наши шансы обнаружить людей из группы риска и убедить их отказаться от сигарет", - говорит Кэри Стефанссон, главный исполнительный директор корпорации Decode Genetics, возглавлявшей одно из исследований.


Источник: Die Welt


27 апр 2010, 21:01
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Вошь расскажет про человека: «Вшивая» ДНК в антропологии

Использовав ДНК для того, чтобы отследить эволюционный разрыв между головной вошью и нательной (ее также называют платяной), ученые пришли к выводу, что последняя впервые «появилась на сцене» примерно 190 тысяч лет назад. И это изменение, полагают иследователи, произошло вскоре после того, как люди начали носить одежду.

«Новая работа, представленная 16 апреля на ежегодной встрече Американского общества физических антропологов, проливает свет на неочевидные аспекты культурного развития, которые позволили людям обосноваться в северных холодных регионах», - говорит Эндрю Китчен из Пенсильванского университета. Ученые, ранее испытывавшие нехватку прямых доказательств, полагали, что одежда появилась где-то в период от 1 миллиона до 40 тысяч лет тому назад.

Выполненный анализ митохондриальной ДНК, полученной от двух современных видов вшей, показал, что нательная вошь произошла от головной примерно 70 тысяч лет тому назад. Поскольку нательная вошь размножается в складках одежды, скорее всего, она появилась вскоре после изобретения собственно одежды, полагают ученые.

Хотя митохондриальная ДНК хорошо подходит для определения хронологии эволюционных событий, она представляет собой относительно небольшую часть генома. Команда Китчена исследовала образцы как митохондриальной, так и ядерной ДНК обоих видов вшей, чтобы возможно более точно определить время возникновения нательной вши как вида.

«Имеет смысл, что люди или, возможно, неандертальцы, обитавшие в холодных районах Европы, начали делать одежду примерно 190 тысяч лет назад, - поясняет Китчен, - поскольку оба вида к тому моменту утратили большую часть волос на теле и узнали, как делать каменные орудия для обработки звериных шкур. Вид Homo Sapiens появился примерно 200 тысяч лет назад».

«Возможно, добавляет ученый, - нательная вошь как вид появилась всего за несколько поколений. Никаких доказательств того, что это головная вошь произошла от платяной, обнаружено не было».

Источник wired.com
http://www.popmech.ru/article/7008-vosh ... cheloveka/


27 апр 2010, 21:27
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Лягушка носит гены человеческих болезней


Первый геном амфибии расшифрован силами большой международной команды, в которую входят ведущие геномные центры США, Великобритании, Японии, Франции и Канады; координаторы работы – Объединенный институт генома (Joint Genome Institute) в Уолнат Крик и Центр объединенного генома (Center for Integrative Genomics) Калифорнийского университета в Беркли. Ученые секвенировали ядерную ДНК западной шпорцевой лягушки Xenopus tropicalis.

Родовое название шпорцевых лягушек Xenopus на латыни означает «странная нога» — пальцы ее задних ног снабжены коготками, которыми лягушка защищается от хищников и удерживается на стеблях растений. Африканская шпорцевая лягушка Xenopus laevis – излюбленный модельный объект эмбриологов. У нее крупная прозрачная икра, внешнее оплодотворение, а ее эмбрионами легко манипулировать. Но африканская лягушка – тетраплоид, в ее клетках содержится не двойной, а четверной набор генов, и ее геном очень велик – около 3,1 миллиарда пар оснований. По этой причине ученые выбрали для секвенирования геном другого вида — Xenopus tropicalis. В его геноме всего 1,7 миллиарда пар оснований.

Уффе Хелстен (Uffe Hellsten) и его коллеги не только расшифровали ДНК-последовательность лягушачьего генома, но и провели его структурный и сравнительный анализ – сравнили с геномом человека и курицы.У лягушки столько же генов, сколько у человека

Большое количество генов лягушка получила от общего предка всех позвоночных, жившего примерно 360 миллионов лет назад. Именно тогда амфибии отделились от высших позвоночных (рептилий, птиц и млекопитающих).

У шпорцевой лягушки ученые насчитали 20-21 тысячу генов, кодирующих белки. Это приблизительно столько же, сколько у человека. Интересно, что большая часть этих генов гомологична генам человека, то есть имеет общее с ними происхождение. Например, у 79% всех генов, связанных с человеческими заболеваниями, нашлись родственники в геноме лягушки. Поэтому, полагают ученые, лягушка может послужить моделью для изучения механизмов и способов лечения многих болезней человека.

Целые блоки лягушачьего генома, находящиеся на одной хромосоме, по расположению генов оказались сходны с блоками геномов человека и курицы. Молекулярные генетики называют это синтеничностью. В то же время ученые нашли специфичные для амфибий слияния и разрывы хромосом, которые, очевидно, возникли уже после расхождения линий амфибий и высших позвоночных.

Более трети генома лягушки состоит из мобильных элементов. Это выше, чем у курицы (9%), и близко к 40-50% у человека. По большей части это ДНК-транспозоны, а не ретротранспозоны, как у человека (отличие одних от других заключается в том, что ДНК-транспозоны распространяются по геному напрямую, без помощи РНК). Некоторые мобильные элементы не встречаются у млекопитающих, рептилий и птиц, что указывает на их возникновение у амфибий после расхождения ветвей эволюции.В чем лягушка нас обскакала

Геном лягушки содержит 1850 генных семейств, возникших путем умножения генов (от двух до 160 копий). Больше всего умножаются гены обонятельных, вкусовых рецепторов и вомероназального органа, воспринимающего феромоны.

Отличие есть и в генах, определяющих ранние стадии развития эмбриона – бластулу и гаструлу. У млекопитающих один ген nodal, в то время как у лягушки это семейство состоит из шести генов. Анализ показал, что человек и курица потеряли гены семейства nodal, причем разные, а у лягушки присутствует полный комплект. Другие эмбриональные гены присутствуют в геноме лягушки, рыб и курицы, но отсутствуют у человека.

У амфибий есть также очень важные для них гены, которые утеряны у высших позвоночных. Это гены, кодирующие антимикробные белки кожи (церулин, ксенопсин и другие). Белки выделяются кожными железами и играют большую роль в защите амфибий от инфекций.

Как и у других позвоночных, в геноме лягушки есть «генные пустыни» — участки некодирующих последовательностей, они занимают около17%.

Расшифровка генома шпорцевой лягушки очень полезна для общего понимания эволюции генома позвоночных, говорят ученые. Но результаты могут помочь и самим лягушкам выжить в современном мире. Известно, что амфибии за последние годы сильно пострадали. Они сильнее, чем прочие животные, страдают от загрязненной среды обитания, так что состояние популяций может служить индикатором загрязнения. Генные методы помогут сделать этот индикатор еще более точным, так как на молекулярном уровне покажут, как земноводные реагируют на экологические изменения.

Результаты анализа лягушачьего генома опубликованы в последнем выпуске журнала Science.
http://news.rambler.ru/Russia/scitech/6201063/


30 апр 2010, 17:18
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Ученые выявили гены, запускающие сезонные изменения в организме


МОСКВА, 30 апр - РИА Новости. Британские ученые выявили гены, которые определяют изменения в работе гормонов при смене сезонов, что можно в будущем использовать при лечении зимней депрессии у людей, сообщается в статье исследователей, опубликованной в журнале Current Biology.

Долгое время среди научного сообщества доминировала гипотеза, что гормональные изменения в организме при смене сезонов подчиняются сигнальным молекулам, получившим название "тубералины". Их вырабатывает маленькая доля головного мозга - гипофиз. Гипотеза базировалась на том, что на гипофиз воздействует гормон мелатонин, выработка которого у млекопитающих напрямую зависит от продолжительности светлого времени суток.

"Ученым было известно о существовании этих загадочных "тубералинов", однако до последнего времени никто не знал, как они работают", - отмечает руководитель группы ученых из Университета Эдинбурга профессор Дэйв Барт (Dave Burt), слова которого приводит пресс-служба университета.

Для того, чтобы выявить эти молекулы, исследователи изучали работу нескольких тысяч генов в гипофизе британских овец с острова Соэй. Эта порода овец была выбрана, потому что сохранилась в неизменном виде еще с бронзового века. Считается, что работа биологических часов этих овец не была затронута во время многочисленных скрещиваний и селекций.

Ученым удалось установить два гена - TAC1 и EYA3 - активация которых в гипофизе происходит наиболее активно в ответ на сезонное изменение продолжительности светлого времени суток. При этом активация TAC1 приводит к выработке специфических белковых молекул. Они выполняют сигнальные функции и запускают выработку в мозге другого гормона - пролактина, действие которого на организм животных, как считают ученые, помогает им приспособиться к меняющимся со сменой сезонов условиям окружающей среды. Эти белковые молекулы, по мнению авторов исследования, подходят на роль "тубералинов".

Из научных работ других групп известно, что один из двух выявленных генов, называемый EYA3, выполняет аналогичные функции и у птиц, что говорит о сохранении механизма сезонной гормональной регуляции как минимум в течение 300 миллионов лет - именно столько лет назад жил общий предок птиц и млекопитающих.

"Открытие этих двух генов не только проливает свет на работу (человеческих) внутренних часов, совершающих полный оборот за один календарный год, но и позволяет найти параллели с таким же биологическим механизмом у птиц", - отмечает профессор Барт.

http://www.rian.ru/science/20100430/228675621.html


02 май 2010, 22:57
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Ген-хранитель: Щит против СПИДа

Исследование, проведенное в Институте Рагона, может послужить основой для создания эффективной вакцины против СПИДа

Для человека, зараженного ВИЧ, при отсутствии медикаментозного лечения развитие СПИДа, как правило - лишь вопрос времени. Тем не менее, у небольшого числа людей, подвергшихся воздействию вируса иммунодефицита, СПИД развивается очень медленно или не развивается вообще.

В конце 1990-х годов исследователи показали, что очень высокий процент людей, имеющих естественный иммунитет против ВИЧ (а их число составляет примерно 1 на 200 зараженных), является носителями гена HLA B57. В настоящее время группа исследователей из Института Рагона выявила эффект, обеспечивающий способность этого гена поддерживать иммунитет против ВИЧ.

Исследовательская группа под руководством профессора MIT Арупа Чакраборти (Arup Chakraborty) и профессора Гарварда Брюса Уолкера (Bruce Walker) установила, что ген является причиной формирования в человеческом организме Т-клеток, которые «распознают» большее число фрагментов белка ВИЧ, что позволяет им эффективнее уничтожать вирусы, в том числе их мутировавшие версии. Этот эффект позволяет контролировать ВИЧ-инфекцию (а также любой другой активно развивающийся вирус), но, с другой стороны, делает носителей гена более восприимчивыми к аутоиммунным заболеваниям.

Новые знания, полученные в ходе исследования, могут помочь ученым в разработке вакцин, которые вызывают такую же реакцию на ВИЧ, какую носители гена HLA B57 вырабатывают самостоятельно.

Внимание ученых было сосредоточено на одном из видов Т-клеток, а именно Т-киллерах (Т-цитотоксических клетках), отвечающих за уничтожение клеток организма, пораженных заболеванием. Т-киллеры распознают фрагменты чужеродных белков (эпитопы), экспрессированные на поверхности клетки, и в случае, если этот фрагмент определен как «вражеский», уничтожают клетку и продуцируют гамма-интерферон, который ограничивает проникновение вируса в соседние клетки. Каждая Т-цитотоксическая клетка «настроена» только на один специфический антиген и убивает только клетки с эти антигеном.

Однако новое исследование показало, что организм носителей гена HLA B57 вырабатывает большее число Т-киллеров, которые к тому же являются кросс-реактивными, т.е. могут распознавать более чем один эпитоп, и благодаря этому уничтожать и мутировавшие вирусы иммудодефицита.

Профессор Чакраборти говорит, что у людей, лишенных гена HLA B57, кросс-реактивные Т-киллеры также присутствуют, но в гораздо меньших количествах. Результаты исследования позволяют надеяться на создание вакцины, способной увеличить их число.

Чакраборти и его коллеги ранее разработали расчетную модель развития Т-киллеров в тимусе, где они проходят отбор, направленный на отсеивание как слишком «слабых» клеток, плохо распознающих угрозу, так и слишком «агрессивных», набрасывающихся на здоровые клетки организма.

В тимусе Т-киллеры взаимодействуют с собственными пептидами человеческого организма, и в зависимости от реакции на эти пептиды либо успешно проходят «проверку на агрессивность», либо погибают. Тип и количество собственных пептидов, с которыми сталкиваются Т-киллеры, определяется генами HLA. Ученые показали, что HLA B57, наряду с HLA B27 (носители которого также демонстрируют наличие иммунитета против ВИЧ), обеспечивает минимальное количество собственных пептидов, в результате чего Т-киллерам проще выдержать «экзамен». В результате тимус покидают Т-клетки, обладающие более высокой кросс-реактивностью и способностью к уничтожению большего числа форм ВИЧ, но в то же время более опасные для здоровых клеток организма. Эта модель также объясняет причину повышенного риска возникновения аутоиммунных заболеваний у носителей гена HLA B57.

По пресс-релизу MIT News

http://www.popmech.ru/article/7064-gen-hranitel/


06 май 2010, 21:45
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Джонатан Лик | The Sunday Times

Девочка, над которой не властно время, может стать ключом к загадке старения

Американские ученые надеются разгадать загадку старения, расшифровав геном 17-летней девушки, которая доселе физически и умственно остается на уровне годовалого ребенка, пишет The Sunday Times. Вес Брук Гринберг - 16 фунтов, рост - всего 30 дюймов. Предварительные исследования ее ДНК наводят на мысль, что она не растет из-за сбоев в генах, отвечающих у нормальных людей за старение, поясняет журналист Джонатан Лик. На примере Брук удастся идентифицировать такие гены, проникнуть в механизмы их работы, научиться ими управлять, надеется Ричард Уолкер из Медицинской школы Университета Южной Флориды, руководящий исследованиями.

"Недавно ученые совершили несколько революционных открытий, доказав, что благодаря мелкой "редактуре" отдельных генов можно необычайно продлить продолжительность жизни многих животных" - червей и мышей, пишет газета. "В генетическом плане мыши - очень близкие родственники людей", - подчеркнула Синтия Кенион, биохимик из Калифорнийского университета (Сан-Франциско). Предположение, что старением управляют несколько ключевых генов, разделяет Элина Слагбоом из Лейденского университета (Голландия), профессор молекулярной эпидемиологии. Она собрала данные о 30500 лицах из кланов долгожителей и заключила, что они попросту медленнее стареют.

Источник: The Sunday Times

Джереми Лоренс | Independent

Неужели эликсир молодости подоспел?

Ученые утверждают, что к 2012 году они разработают лекарства, замедляющие процесс старения, пишет The Independent.

Наша генетическая наследственность превосходит все прочие факторы в определении того, как долго мы живем и насколько хорошо выглядим. Выявив генетические факторы долгожительства, ученые надеются научиться управлять ими, не только добавляя годы к жизни, но и вдыхая жизнь в преклонные годы. Эликсир молодости остается недостижимой мечтой, однако появление медикаментов, которые помогут нам жить дольше, не за горами, пишет автор статьи Джереми Лоренс.

Последние открытия в области генетики знаменуют собой начало новой эры исследования продолжительности жизни, и лекарства, созданные на этой основе, возможно, будут "доступны для испытаний начиная с 2012 года", отметил на конференции профессор Нир Барзилаи из Колледжа медицины им. Альберта Эйнштейна в Нью-Йорке.

"Я вижу 100-летних людей, которые к тому же сохраняют хорошую форму. Они водят машину, рисуют, и они говорят, что жизнь прекрасна. Эта тенденция заставляет меня верить, что у нас как у биологического вида есть способность доживать до 100, если мы предотвратим некоторые из возрастных заболеваний", - заявил он.

У долгожителей имеются гены, которые откладывают развитие таких состояний, как болезнь Альцгеймера и сердечные заболевания. Старение нельзя повернуть вспять, но, вероятно, можно замедлить, говорится в статье.

В перспективе Барзилаи видит создание таблетки, которая бы предотвращала признаки старения, и принималась бы раз день при достижении человеком 40 или 50 лет. Но, чтобы добиться ее появления, старение следует классифицировать как подлежащее лечению состояние, чтобы стимулировать приток средств на ее разработку.

Источник: Independent

Элена Дузи | La Repubblica

ДНК в супермаркете: в продаже появился набор для выявления будущих болезней

Генетики возмущены: "Этот бизнес вредит нашей работе", пишет Элена Дузи в статье, напечатанной в газете La Repubblica.

"Раскрой свою ДНК" - гласит надпись на упаковке. Первый шаг простой и внушающий доверие. Речь идет о том, чтобы заплатить 20 долларов за приемник для слюны, который вчера впервые появился на прилавках американских супермаркетов. Затем, чтобы узнать, какие болезни скрываются в его геноме, клиенту следует направить образец в компанию Pathway Genomics и дождаться результатов, которые придут по интернету максимум за 249 долларов. К числу болезней, угрозу появления которых можно спрогнозировать, относятся: Альцгеймер, опухоли, диабет 2-го типа, сердечно-сосудистые заболевания, глаукома, ожирение и артроз, а также угроза различных аллергий или реакций на некоторые лекарственные препараты, индивидуальный уровень чувствительности к кофеину и многое другое", - пишет автор статьи.

Слишком просто, полагают те, кто опасается того, что революция в медицине XXI века - исследование человеческой ДНК - будет сведена к бизнесу на уровне розничной торговли без медицинского наблюдения и оказания помощи пациентам в расшифровке результатов анализа. Власти штата Нью-Йорк запретили продажу продукта, который, по их мнению, является "медицинским тестом". Однако же набор будет продаваться в 7500 супермаркетах Walgreens в других штатах страны, а скоро его можно будет купить и в интернете.

"То, что речь идет о коммерческом маневре, совершенно ясно, и он может лишь навредить нашей работе, - говорит Джузеппе Новелли, генетик и руководитель медицинского факультета университета Tor Vergata. - Генетические тесты являются крайне ценным инструментом, их проводят и расшифровывают с большой тщательностью". Генетический тест, по словам ученого, не дает конкретного ответа, а идентифицирует присутствие возможных мутаций между несколькими генами, которые уже известны ученым. Эти мутации позволяют определить процент риска заболеть какой-то определенной болезнью. Но риск - это не неизбежность: помимо генетической предрасположенности существуют факторы окружающей среды, которые оказывают серьезное влияние на здоровье, пишет автор статьи.

Источник: La Repubblica


13 май 2010, 14:23
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Нанороботу найдут применение в медицине

Американские ученые из Колумбийского университета создали и запрограммировали робота величиной с молекулу. Национальный научный фонд США полагает, что со временем наноробот может приобрести важное прикладное значение, в частности, в медицине.

Исследователи работали с так называемыми «ДНК-бродилками», т.е. цепочками перепрограммированной ДНК с «ножками», позволяющими им двигаться. Группе удалось показать, что эти «паучки» величиной всего 4 нанометра в диаметре, в состоянии автономно перемещаться в специально созданном двухмерном пространстве и выполнять простейшие функции, присущие роботам: начинать движение, поворачивать, останавливаться.

http://www.annews.ru/news/detail.php?ID=224602


14 май 2010, 11:47
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Генетическая "кнопка" включает производство "хорошего" холестерина


МОСКВА, 14 мая - РИА Новости. Повысить в организме уровень "хорошего" холестерина, препятствующего развитию атеросклероза и других заболеваний, можно, если блокировать микро-РНК, которая регулирует работу соответствующих генов, сообщают авторы исследований, опубликованных в пятницу в журнале Science.

Холестерин, необходимый для выработки витамина D и некоторых гормонов, а также для образования клеточных стенок, организм получает из пищи и синтезирует самостоятельно. В крови холестерин находится в составе комплексных соединений, липопротеинов.

Липопротеины низкой плотности называют "плохим холестерином", поскольку он может оседать на стенках сосудов, ограничивая кровоток. "Хороший холестерин", липопротеины высокой плотности, напротив, существенно снижают риск развития атеросклероза и сердечно-сосудистых заболеваний.

Две независимых группы исследователей под руководством доктора Кэтрин Мур (Kathryn Moore) из Нью-Йоркского университета и Андерса Наара (Anders Naar) из медицинской школы Гарварда обнаружили, что микро-РНК под названием miR-33 регулирует работу генов, связанных с транспортировкой клеточного холестерина. Блокировка ее действия у мышей увеличивает уровень "хорошего" холестерина на 25%, почти так же, как и прием ниацина, или витамина B3.

"Липопротеины высокой плотности, или "хороший" холестерин, как считается, защищают от атеросклероза, и методы лечения на их основе сегодня - передовой край исследований сердечно-сосудистой системы. Наша работа выявила новый способ регулирования уровней "хорошего" холестерина и предполагает, что антагонисты miR-33 имеют колоссальный потенциал использования вкупе с традиционными методами снижения уровня "плохого" холестерина", - сказала доктор Мур, чьи слова приводятся в пресс-релизе университета.

Команда Наара изучала группу генов, регулирующих липидный баланс, и обратила внимание на miR-33, которая имеется у различных живых организмов, от дрозофилы до человека. Они исследовали ее функции и затем экспериментально убедились, что инъекции препаратов, блокирующих действие miR-33 у мышей, существенно повышают уровни "хорошего" холестерина в плазме крови. Аналогичным образом работала группа Мур, которой удалось варьировать уровень липопротеинов высокой плотности у мышей почти на четверть, усиливая или ослабляя действие miR-33.

"Наши результаты демонстрируют возможность терапевтического направленного подавления miR-33 как нового способа повышения уровней липопротеинов высокой плотности у лиц, страдающих кардиометаболическими заболеваниями", - заключают авторы одной из статей.

Найдены гены, позволяющие тибетцам выживать при нехватке кислорода

МОСКВА, 14 мая - РИА Новости. Жители Тибета могут успешно выживать на очень большой высоте, где житель равнин из-за недостатка кислорода может серьезно заболеть, благодаря двум генетическим мутациям, которые удерживают уровень гемоглобина в крови на низком уровне, говорится в исследовании, опубликованном в пятницу в журнале Science.

Авторы исследования, Татум Симонсон (Tatum Simonson) из университета Юты и его коллеги из США и Китая, отмечают, что жители Тибета, поселившиеся в этой горной стране примерно 5-7 тысяч лет назад, выработали целый набор физиологических особенностей, позволяющих переносить пониженное содержание кислорода, которое у "гостей" региона может спровоцировать горную болезнь и даже опасные воспалительные заболевания мозга и сердца.

В частности, у тибетцев в ответ на нехватку кислорода не развивается полицитемия - избыточное производство в организме красных кровяных клеток, эритроцитов, не бывает отеков мозга и легких, не возникает повышенное давление в легочных артериях.

"Очевидно, что эти особенности - результат адаптации к среде, но их генетический базис оставался неизвестным", - отмечают ученые.

Чтобы выяснить, какие именно генетические особенности позволяют тибетцам без проблем жить на высоте более 4 тысяч метров, авторы исследования изучили около 70 геномов жителей тибетской деревни, расположенной на высоте 4,5 тысячи метров, и сопоставили полученные данные с геномами жителей равнинного Китая и Японии, взятыми в базе данных проекта HapMap.

Группа Симонсона вычленила мутации, часто встречающиеся у тибетцев и никогда - у жителей равнин, а также те, о которых было известно, что они связаны с адаптацией к высоте. В результате, из 247 генов-кандидатов ученые выделили десять генов, обуславливающих высотную устойчивость жителей Тибета.

В их числе оказались гены EGLN1 и PPARA, которые, делают вывод ученые, и ответственны за низкий уровень гемоглобина у тибетцев.

Авторы статьи подчеркивают, что их исследование поможет лучше понять реакции человеческого организма на нехватку кислорода и помочь в лечении и профилактики горной болезни, отеков легких и мозга, и других связанных с гипоксией заболеваний.

Видео: http://www.rian.ru/science/20100514/234276510.html

Страх перед запахами может быть генетически запрограммирован в мозге


МОСКВА, 14 мая - РИА Новости. Мыши генетически запрограммированы бояться некоторых запахов хищников, даже если самих хищников они никогда не видели, это открытие поможет исследовать, как подобная информация обрабатывается человеческим мозгом, сообщается в статье ученых, опубликованной в журнале Cell.

"Мы намерены выяснить, может ли мозг или какая-либо его область быть изначально запрограммированной откликаться на химические сигналы окружающей среды и как этот отклик может сказаться на сложном поведении животных", - сказала ведущий автор публикации Лиза Стоуэрс (Lisa Stowers), слова которой приводит пресс-служба Скриппсовского исследовательского института в США.

Ученым давно было известно, что даже никогда не видев хищника в своей жизни, лабораторные мыши испытывают страх перед запахами, соответствующими змеям, кошкам и другим животным. Тем не менее, до самого последнего времени ученым не было известно, какой именно запах вызывает у мышей это чувство. Группе Стоуэрс удалось впервые показать, что этим запахом обладает молекула из класса основных белков мочи животных, которые те выделяют для передачи информации между особями внутри своего вида.

В своей работе ученые предположили, что для выявления этого специфического запаха грызуны используют отдельный орган, так называемый "вомероназальный орган", расположенный в носу животных. Основное его предназначение - определять наличие в воздухе феромонов (информационных ароматических молекул) своих собратьев.

Для того, чтобы проверить эту гипотезу, ученые вывели мутантную линию мышей, работа вомероназального органа которых была заблокирована. После этого ученые подбрасывали в клетки к животным ватные шарики, смоченные слюной, мочой или эссенцией змеиной кожи. Животные из контрольной группы с работающим вомероназальным органом, как и подобает испуганным грызунам, забивались в углы клеток, испытывая страх перед запахом хищника, тогда как мутантная линия животных не показывала каких-либо изменений в своем поведении.

При этом мыши, принявшие участие в эксперименте, были выведены в условиях стерильного вивария, в которых жили сотни поколений их предков, никогда в жизни не сталкивавшихся с хищниками.

"Эти мыши появляются на свет уже со способностью различать запахи хищников", - сказала Стоуэрс.

Разделив слюну и мочу животных на отдельные химические компоненты и проделав аналогичную работу, ученые сумели установить, что за запах, вызывающий страх у грызунов, отвечает белковая молекула из класса основных белков мочи, используемая кошками для передачи угрозы соперникам или подготовки к сражению с соперником. Молекулы из этого же класса соединений содержатся и в моче самих грызунов, а их запах может часто сопровождается соперничеством между самцами.

Это означает, что подобные химические соединения используются не только для передачи информации внутри одного вида, но и для межвидовой коммуникации.

Ученые полагают, что эта работа в будущем может быть использована для изучения того, как чувство страха в ответ на внешние сигналы вырабатывается у людей.

"Чувство страха, практически, идентично по своей природе у мышей и у людей", - подытожила Стоуэрс.

http://www.rian.ru/science/


15 май 2010, 13:13
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
17 мая 2010 г.

Джонатан Лик | The Sunday Times

Открытие: гены, которые позволят вам дожить до ста лет

Ученые обнаружили "гены Мафусаила": у счастливых обладателей таковых гораздо больше шансов дожить до ста лет, даже если они будут вести нездоровый образ жизни, пишет The Sunday Times.

"Похоже, эти гены защищают людей от последствий курения и неправильного питания и могут отложить начало таких возрастных заболеваний, как рак и болезни сердца, на три десятилетия", - пишет автор статьи Джонатан Лик.

"Ни один ген не является источником молодости. Однако, в соответствии с новыми исследованиями в отношении долгожителей и их семей, секрет долгожительства, возможно, кроется в наличии правильного набора генов. Такое сочетание является крайне редким - только один человек из 10 тысяч достигает ста лет", - продолжает автор.

"У долгожителей не меньше генов заболеваний или старения, - утверждает Элин Слэгбум из Университета Лейдена, возглавляющая исследование, изучающее три с половиной тысячи голландских долгожителей. - Но у них есть другие гены, которые препятствуют запуску этих генов заболеваний. Долгожительство, безусловно, является генетическим и наследственным явлением".


Источник: The Sunday Times


17 май 2010, 15:55
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Биологи опровергли существование «темной материи» из РНК

Лента.Ру

Исследователи доказали, что в клетке существует намного меньше «странных» молекул РНК, чем считалось до сих пор. В предыдущих экспериментах ученые нашли множество РНК, которые не участвуют в синтезе белков и клеточной регуляции. Новая работа, опубликованная в журнале PLoS ONE показала, что такие РНК были артефактами эксперимента. Коротко об исследовании пишет портал Nature News.

Молекулы РНК, согласно современным представлениям, выполняют в клетке две основные функции: они участвуют в синтезе белков, а также задействованы в клеточной регуляции (кроме того, они входят в состав некоторых ферментативных комплексов с белками). Все РНК синтезируются в клетке на матрице молекул ДНК, причем те РНК, которые нужны для синтеза белков, копируются как раз с тех участков ДНК, которые кодируют гены. РНК, задействованные в клеточной регуляции, также синтезируются на основе «геноподобных» участков ДНК.

Однако несколько лет назад ученые нашли в клетке множество молекул РНК, которые не задействованы ни в одном из названных выше процессов. Они синтезировались с участков ДНК, где не было никаких генов. Исследователи не могли объяснить их существование, так как не могли выяснить, какие функции выполняют эти РНК. При этом такие «странные» РНК синтезировались, по некоторым оценкам, с более чем 98 процентов ДНК, не кодирующей белки.

Загадочные молекулы были найдены при помощи технологии микрочипов. Этот метод заключается в следующем: на предметное стекло наносят множество последовательностей ДНК, которые покрывают какой-то большой фрагмент генома (или даже геном целиком). После этого на стекло наносят экстракт клеточных РНК и смотрят, с какими из нанесенных на стекло последовательностей они гибридизуются (то есть образуют прочную пару по принципу комплементарности ). Такой способ позволяет быстро получать информацию об огромном числе молекул, однако у него есть один серьезный недостаток — клеточные РНК могут гибридизоваться не только с «правильными» мишенями на чипе, но также и с посторонними молекулами.

Авторы новой работы предположили, что огромное число «странных» РНК появляются именно из-за несовершенства метода. Чтобы проверить свою теорию, ученые исследовали клеточные РНК параллельно двумя различными способами — при помощи микрочипов и при помощи недавно изобретенной технологии потокового секвенирования (определения последовательности) РНК. Потоковое РНК-секвенирование — это значительно более «прецизионный» метод, чем технология микрочипов. По итогам сравнения исследователи выяснили, что для одного и того же клеточного экстракта микрочипы дают огромное количество «странных» РНК, а при РНК-секвенирование обнаруживаются всего несколько таких РНК.

Несмотря на то что молекулярная биология является одной из самых быстро развивающихся наук, ученые еще очень многого не знают о базовых принципах устройства клетки. Например, в прошлом году исследователи показали, что один из основополагающих принципов, утверждающий, что «считывание» генома с одной и той же «стартовой точки» идет всегда в одном направлении — оказался неверным .


20 май 2010, 17:08
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 12 июн 2009, 00:05
Сообщения: 7311
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
В Испании клонировали быка для корриды

В испанской Паленсии родился первый в мире клонированный боевой бык. Малыш по кличке Ваза весит 25 килограммов и является результатом трехлетней работы испанских и сербских ученых.

Отцом теленка является лучший племенной производитель престижной кадисской фермы имени Альфонсо Гвардиолы, известный по кличке Вазочка.
Для получения эмбриона исследователи Висенте Торрент, Рита Сервера и Миодраг Стойкович из валенсийского ветеринарного фонда FVIV взяли крошечный кусочек кожи самца (размером 0,5 сантиметра), извлекли из него клетку, а полученное ядро поместили в яйцеклетку коровы породы боевой бык. Суррогатной матерью стала представительница местной паленсийской молочной породы Леонис.
Спустя девять месяцев и 15 суток в ночь на вторник 18 мая на свет появился здоровый, черный как смоль теленок Ваза, фотокопия своего уже скончавшегося отца, сообщает испанская газета ABC. В ближайшие время должен родиться его единокровный брат, которому уготована кличка Стекло.
Торрент объяснил, что Ваза — первый клонированный боевой бык и в Испании, и в мире. Ранее клонировали лишь быков, участвующих в североамериканском родео.
"Наша цель — опробовать технологию, которая позволит клонировать любое млекопитающее, которому грозит вымирание, с тем, чтобы не исчезали ценные животные", — заявил Торрент. На планете обитает несколько тысяч представителей породы боевой бык. Ее вывели в XV-XVI веках в окрестностях Вальядолида.
Вазу не пустят на арену. Ветеринары надеются понаблюдать за ним 15−20 лет: именно столько в среднем живут представители этой породы.
На вопрос журналистов, имеет ли его исследование практическое применение в корриде, Торрент ответил: "По-моему, будет очень интересно посмотреть, как шесть тореадоров сразятся с шестью одинаковыми быками".

http://x-files.org.ua/news.php?readmore=1908


25 май 2010, 12:32
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Мышь неубиваемая: Генное заживление

Отключение одного-единственного гена позволяет мышам развить способности к регенерации потерянных тканей.

12 лет назад с доктором Эллен Хебер-Кац (Ellen Heber-Katz) случилось то, что случалось иногда и с другими учеными – даже самыми великими. Она сделала случайное открытие. Говоря точнее, Хебер-Кац заметила, что представители линия генетически модифицированных мышей Murphy Roth Large (MRL) способны полностью заживлять отверстие в ухе, которое остается от бирок, которыми ученые метят особей во время экспериментов. Легко представить, с каким волнением Хебер-Кац подумала: «Уж не о ней ли речь? Не о регенерации?»

Регенерация тканей, часто встречающаяся у более «простых» животных, у млекопитающих неизвестна. Но она могла бы подарить нам совершенно новую медицину – и совершенно новые клетки, ткани и даже органы.

Уцепившись за это наблюдение, ученая продолжила исследовать линию MRL и обнаружила, что раной в ухе их способности не ограничиваются. Каждые несколько лет Хебер-Кац обнаруживает нечто новое, а на днях, наконец, ее группа совершила долгожданный прорыв. Показано, что секрет MRL-мышей – всего в одном небольшом белке и, манипулируя соответствующим геном, можно наделить этими же удивительными способностями других мышей!

Конечно, это еще не означает, что через годик-другой в каждой больнице вам смогут вырастить новую почку взамен износившейся. Но все-таки, если исследование регенерации у мышей показывает, что значительного повышения этой способности можно добиться за счет одного-единственного гена, то, возможно, и у нас соответствующий механизм не слишком сложен и в один прекрасный день вполне может стать объектом генной терапии.

Тем более что детали, которые удалось выяснить команде Хебер-Кац, впечатляют. Ими было показано, что в районе повреждения на ухе у мышей линии MRL не идет экспрессия гена, кодирующего белок p21 (ингибитор циклин-зависимой киназы 1А), который является одним из важных регуляторов процесса деления клетки. И если подавить действие этого гена у нормальных мышей, они демонстрируют ту же высокую способность к заживлению ран.

У человека этот ген и этот белок также имеются. Но просто «отключить» ген не получится, поскольку от нормальной его работы зависит нормальность размножения клеток. Безответственно манипулируя этим регуляторным инструментом, мы рискуем прийти к бесконтрольному делению клеток тела – то есть, практически к раку. И вообще, Хебер-Кац с коллегами показали, что и у регенеративных способностей MRL-мышей имеются свои ограничения. Отлично восстанавливаются ткани уха и сердца, а вот потерянные конечности (увы) не отрастают. Может отрасти кончик пальца, но не сустав. До ящериц им далеко.

Впрочем, активные исследования позволяют надеяться на то, что однажды врачи, генные терапевты будут запросто давать пациентам «волшебную таблетку», которая позволит отрастить потерянную в аварии конечность или печень, измученную «Нарзаном». О некоторых других работах и находках в этой области читайте: «Клеточный контроль» и «Сердце рыбы».

По пресс-релизу Wistar Institute

http://www.popmech.ru/article/7126-myish-neubivaemaya/

Первопредок: От бактерий до людей

Генетический анализ, математика и компьютеры подтвердили простую, но дерзкую гипотезу Дарвина: у всех живых организмов, от водоросли до депутата, имеется один общий предок.

Больше 150 лет назад Чарльз Дарвин высказал предположение о существовании некоего прото-организма, единого общего предка, из которого уже эволюционные процессы породили все виды живых организмов, от кишечной палочки до доктора наук, в котором эти палочки обитают. К сожалению, это предположение так и осталось предположением. И сегодня возможности даже самого изощренного генетического анализа слишком слабы для того, чтобы формально продемонстрировать родственность бактерий и людей – а также берез, дрожжей, бегемотов и всех прочих живых существ.

Впрочем, на прошлой неделе опубликовано первое исследование, в котором ученые провели достаточно масштабный количественный анализ – и подтвердили: Дарвин был прав.

Вообще, начиная с 1859 г., когда в знаменитом дарвиновском «Происхождении видов» прозвучала мысль о «первопредке», свидетельств в ее пользу накопилось порядочно. Взять хотя бы обнаружение множества переходных форм жизни (нередко вымерших), позволяющих связать существующие виды в единое, знакомое всем древо, уходящее корнями в незапамятную глубину. Или – поразительную близость всех организмов на генетическом и биохимическом уровнях.

Однако все это – косвенные улики, и даже среди биологов-эволюционистов не утихают дискуссии о том, не является ли на самом деле это «древо жизни» несколькими древами, многократно переплетшимися своими ветвями, своего рода «сетью жизни», со множественными сложными связями не только в вертикальном, но и в горизонтальном направлении. Примером такой «сетевой» связности может служить горизонтальный перенос генов, от вида к виду, который, как недавно показано, не только распространен между бактериями, но возможен даже и от кровососущих насекомых – к человеку («Гены комара»). Скорее всего, у ранних, более примитивных организмов такой обмен был куда более рядовым явлением, чем у современных.

Впрочем, по мнению Дугласа Теобальда (Douglas Theobald), неважно, как мы рассматриваем многообразие жизни – в виде древа или сети – если вопрос стоит о «первопредке». Используя всю вычислительную мощь современных компьютеров и математического аппарата теории вероятности, он подтвердил, что все живые существа на планете – генетические родственники, хотя порой очень и очень далекие.

По словам Теобальда, на первых этапах жизнь могла зарождаться многократно, но лишь потомки одного из прото-организмов (в том числе и мы с вами) дожили до настоящего времени. Либо изначально возникшие популяции прото-организмов, обмениваясь генами, понемногу «слились» в единого «первопредка», который уже и породил все виды живых организмов на Земле. Независимо от того, какой из сценариев реализовался на практике, родственность всего живого в работе Теобальда показана однозначно. По его данным, наличие общего «первопредка» в миллионы раз более вероятно, нежели наличие множества независимых предков.

Ранее уже проводись сходные генетические исследования, но ученые действовали в куда более узких рамках, отыскивая общие корни, скажем, только у позвоночных. Теобальд же включил в анализ все три надцарства живого – эукариот (включая животных, грибов и растений), прокариот (настоящих бактерий) и архей (архебактерий) – по 4 представителя от каждого. Ученый исследовал 23 белка, отличающихся высочайшей консервативностью (чрезвычайно малой изменчивостью на эволюционной шкале) и встречающихся у всех известных нам организмов.

Читайте также о поисках общего предка всех людей – «Сыновья Адама» и «Дочери Евы».

По пресс-релизу Brandeis University

http://www.popmech.ru/article/7132-pervopredok/

Синтетика: Искусственный геном

Смоделированная на компьютере и созданная в лабораторных условиях хромосома стала основой искусственной жизни.

В появившейся 20 мая на сайте журнала Science публикации исследователи из института Дж. Крейга Вентера (JCVI) представили результаты успешно завершившейся работы по созданию первых синтетических самовоспроизводящихся клеток. Группа синтезировала 1080 тыс. пар оснований хромосомы бактерии Mycoplasma mycoides с модифицированным геномом. Синтезированные клетки были названы Mycoplasma mycoides JCVI-syn1.0. Эта работа послужила доказательством того, что геном может быть разработан на компьютере, воссоздан в лаборатории и трансплантирован в живую клетку, в результате чего на свет появится организм «под управлением» искусственного генома.

Работы по созданию клеток с искусственным геномом ведутся специалистами из JCVI на протяжении почти 15 лет. Чтобы завершить финальную стадию процесса, ученые аккуратно смоделировали цифровой геном бактерии M. mycoides. Им потребовалась создать 1078 нуклеотидных последовательностей, каждая из которых состояла из 1080 пар оснований.

Опираясь на разработанную ранее методику «сборки» генома в дрожжевой клетке, ученые создали искусственную хромосому из фрагментов ДНК. Эта хромосома позже была изолирована из клетки дрожжей и помещена в клетку бактерии Mycoplasma capricolum, из которой предварительно были удалены эндонуклеазы рестрикции - внутриклеточные «охранники», способные уничтожить фрагмент чужеродного ДНК.

После ввода ДНК с синтетическим геномом в клетку произошел перенос генетической информации с ДНК на РНК (транскрипция), и далее – с РНК – на новые белки. Исходный геном Mycoplasma capricolumбыл либо уничтожен эндонуклеазами рестрикции «новичка», либо вытеснен в процессе воспроизводства клеток. По прошествии двух суток жизнеспособные бактерии с искусственным геномом были отчетливо видны в чашках Петри с питательной средой.

Долгое время синтез искусственного генома не приводил к появлению жизнеспособных клеток. Команде JCVI пришлось разработать метод проверки и коррекции ошибок: ученые создавали полусинтетические геномы, комбинируя натуральные и искусственные фрагменты ДНК, и проверяли жизнеспособность результата. Малейшая неточность приводила к полной неудаче, но когда все ошибки были исправлены, на свет появилась первая бактерия с искусственным геномом.

Теперь ученые готовы приступить к работе над следующей задачей – созданием полностью синтетической клетки, содержащей только гены, необходимые для поддержания жизни в самой простейшей форме.

В своей публикации 2008 г., посвященной синтезу генома M. genitalium, исследователи описывали возможность создания «водяных знаков», заключенных в геноме. Эти специально разработанные сегменты ДНК используют «алфавит» генов и белков, который позволяет исследователю кодировать слова и целые фразы. «Водяные знаки» - важное средство определения, является ли геном искусственным или естественным, а также способом идентифицировать лабораторию его происхождения. Ученые из JCVI не преминули закодировать «водяными знаками» нового генома свои имена, адрес электронной почты и три цитаты: «Жить, ошибаться, падать, торжествовать, воссоздавать жизнь из жизни» - Дж. Джойс; «Видеть вещи не такими, какие они есть, а такими, какими они могли бы быть» - цитата из книги «Американский Прометей»; «То, что я не могу построить, я не могу понять» - Р. Фэйнман.

Ученые ожидают, что их методика будет использоваться для создания микроорганизмов в экологических и энергетических целях. Распространение технологии приведет к появлению множества новых областей её применения, таких как создание биотоплива, вакцин, очистка воды, фармацевтическая и пищевая промышленность.

С самого начала работ, направленных на создание искусственного генома, д-р Вентер и его команда сталкивались с рядом социальных проблем, в частности, связанных с этической стороной вопроса. В 1995 г. направление подверглось этической экспертизе в Университете штата Пенсильвания, которая вынесла решение о том, что с точки зрения этики нет никаких препятствий продолжению исследований.

По пресс-релизу JCVI

http://www.popmech.ru/article/7143-sintetika/


26 май 2010, 21:12
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Никита Максимов


А коды летят


Расшифровка человеческих геномов наконец поставлена на поток. Теперь этим занимаются даже в России.


Имя своей недавней пациентки медики из Сент-Луисского госпиталя Барнс не раскрывают. Зато приводят подробную историю болезни. 44-летней американке не повезло - у нее нашли тяжелую форму рака груди. Радиотерапия и самые современные препараты не давали никакого эффекта. Метастазы быстро распространялись по организму, и хирурги просто не успевали их удалять. Спасти женщину не удалось.

Этот случай заболевания оказался очень тяжелым. В самое ближайшее время медики узнают почему. Перед смертью их пациентка подписала согласие на изучение своей ДНК. Взяв у больной пробы, ученые расшифровали сразу несколько геномов. Они «прочитали» не только большую часть ДНК ее здоровых клеток, но и генетический материал опухолей.

Исследователи обнаружили, что в раковых клетках возникло большое количество мутаций. Каждая из них могла сделать болезнь особенно опасной. Эти данные могут быть использованы для создания новых противоопухолевых препаратов. На прошлой неделе генетики опубликовали отчет о своей работе и расшифрованный геном пациентки. Теперь ученые займутся им вплотную.

Всего несколько лет назад про такое исследование сказали бы: это фантастика. Тогда даже самые крупные научные центры не могли позволить себе работать сразу с несколькими геномами одновременно. Сейчас этот барьер преодолен. Сравнительные исследования геномов становятся одним из самых популярных направлений в биологии. Дело тут вовсе не в теоретическом прорыве. Развитие техники окончательно превратило расшифровку геномов из нетривиальной задачи в рутинную процедуру. Теперь это по карману большинству серьезных лабораторий. В декабре прошлого года в число «геномных держав» вошла и Россия. В Курчатовском институте был расшифрован геном больного раком почки. Этот результат тоже может быть очень полезным для медицины. К сожалению, эти ценные данные уже несколько месяцев лежат мертвым грузом.


ПОПУЛЯРНАЯ ГЕНЕТИКА

Для того чтобы понять, насколько доступными стали генетические технологии, специалистом быть не надо - достаточно посмотреть на сметы. Расшифровка первого генома человека заняла тринадцать лет и обошлась примерно в $3 млрд. Сейчас ту же самую процедуру можно легко выполнить за месяц, и стоить это будет около $50 000. Это наконец-то позволяет поставить процесс на поток.

Яркий тому пример - недавнее исследование генетиков из Института системной биологии в Сиэтле. Месяц назад они заявили о расшифровке геномов целой семьи из четырех человек. У супружеской пары не было никаких физических отклонений, а вот оба их ребенка родились с синдромом Миллера. Это тяжелое наследственное заболевание - у больных деформированы лицо и конечности. Сравнив геномы детей и родителей, ученые составили список из четырех генов, мутации в которых могут вызвать такую болезнь. Теперь эти данные можно использовать в различных генетических тестах.

Авторы самой свежей работы - сотрудники американского госпиталя Барнс - тоже работали с несколькими геномами одновременно. Источником наследственного материала была онкологическая больная, у которой ученые взяли образцы сразу нескольких тканей. Сейчас у них на руках практически полностью расшифрованные геномы здоровых и раковых клеток пациентки. Они различаются между собой сорока восемью мутациями в самых разных генах. Пока исследователи не понимают, каким образом каждое из этих изменений могло повлиять на здоровье больной. Но это вопрос времени - подозрительные гены уже взяли на карандаш ученые из лабораторий по всему миру.

Генетические исследования опухолей уже сейчас способны принести практическую пользу. В 2007 году японский молекулярный биолог Хироюки Мано обнаружил, что клетки больных одной из форм рака легких выделяются одной характерной генетической аномалией. Два участка их ДНК сливаются в один большой ген. В результате этого в раковых клетках начинает накапливаться особый белок, с образованием которого связан рост опухоли. Фармацевты изучили эту работу и уже создают препараты, избирательно действующие именно на этот белок.


ОСОБЕННОСТИ НАЦИОНАЛЬНОГО ГЕНОМА

Расшифровка геномов раковых больных сделает поиск таких мишеней значительно более эффективным. Недавно такими исследованиями занялись и в России. В декабре в Курчатовском институте заявили о расшифровке генома россиянина - им стал шестидесятилетний мужчина, больной раком почки. Теперь последовательность его ДНК хранится в базе данных института. «Мы стали полноценным членом геномного сообщества», - радуется Егор Прохорчук, один из авторов работы. Он утверждает, что результаты проекта обязательно окупятся в будущем: «Наши данные помогут понять, какие гены отвечают за предрасположенность к этой форме болезни».

Для этого исследования в институте пришлось оборудовать отдельную лабораторию. Для нее купили пять современных секвенаторов - приборов, позволяющих «считывать» последовательность ДНК. Американская техника обошлась в $7 млн. Расходные материалы - еще в $200 000. Другие расходы Прохорчук оценивать даже не берется. «В условиях России любое техническое задание становится нетривиальным», - сетует он.

Для того чтобы сотрудники центра смогли работать на сложных приборах, им потребовалось дополнительное обучение. В занимаемых лабораторией помещениях пришлось полностью переделать систему вентиляции - чтобы в воздухе было как можно меньше пыли. Кроме того, приборы нужно было подключить к обрабатывающему данные компьютеру. Кабели тянули в другой корпус по территории всего института. Сделали это быстро. Но вот разрешение на перепланировку получали целых два месяца.

В результате государству пришлось потратить на проект сумму, солидную даже по зарубежным меркам. Правда, к тому, как выделялись деньги, у коллег Прохорчука есть большие претензии. «Если государство решает выделить деньги на серьезный проект, следует объявлять конкурс, - говорит заместитель директора по научным вопросам Института проблем передачи информации РАН Михаил Гельфанд. - Тогда у научных коллективов появится возможность соревноваться между собой». От такого конкурса, уверен ученый, государство только выиграло бы: вполне возможно, что другие научные центры справились бы с заданием за меньшие деньги. В 2003 году точно так же негодовал сам Прохорчук. Недавно вернувшийся из Университета Эдинбурга ученый написал письмо в престижный научный журнал Science. В нем он критиковал финансовую сторону российской науки - как раз то, что деньги на исследования зачастую выделяются не по самым прозрачным схемам.

Теперь за непрозрачность работы критикуют уже его самого. Дело в том, что с результатами, полученными в Курчатовском институте, не так-то просто ознакомиться.

Корреспонденту Newsweek разрешили взглянуть на полученные данные с компьютера внутри института. Разумеется, столбики расшифрованного генетического кода журналисту мало чего сказали. Зато они были бы очень интересны специалистам. Но в международных базах данных генома пока нет, а специально созданный сайт russiangenome.ru уже много месяцев находится в состоянии разработки.

«Общепринятая мировая практика состоит в том, что ученые выкладывают свои данные для проверки, - говорит Михаил Гельфанд. - Этого требуют в том числе и журналы, в которых печатаются отчеты о работах». Статьи о расшифровке человеческих геномов с удовольствием публикуют ведущие научные журналы, например Nature. Сотрудники Курчатовского института разместили краткий отчет о работе в только что созданном российском научном журнале Acta Naturae. Статья появилась во втором номере издания, и кроме технического описания работы подробностей в ней нет. «Это была позиция института, - объясняет Егор Прохорчук. - Идея была в том, чтобы опубликовать работу именно в российском журнале».

Возможно, поэтому зарубежные ученые не особенно обсуждают работу российских коллег. Прохорчук уверен, что это временно. Он отказался обсуждать с корреспондентом Newsweek причины, по которым данные так и не были опубликованы. Но пообещал, что это будет обязательно сделано. Тогда, по его словам, и начнется нормальное международное сотрудничество. Трепетное отношение института к своим данным Newsweek объяснил другой ученый, который попросил не называть его имя. Для открытой публикации генома, говорит он, надо было получить разрешение ФСБ.

«Это какой-то бред, - возмущается Евгений Кунин из американского национального центра биотехнологической информации. - Ну что может быть секретного в геноме? В голову приходит только одна причина всей этой таинственности - расшифровка была выполнена некачественно». Кунин - один из самых известных в мире специалистов по обработке биологической информации. Если сотрудники Курчатовского института все же опубликуют свой результат, данные немедленно попадут в его лабораторию.

Возможно, в ближайшее время ученый сможет оценить качество расшифровки «русского генома». Собеседник Newsweek в Курчатовском институте сообщил, что несколько недель назад ФСБ все же дала добро на публикацию результатов. Правда, ученые тут же столкнулись с еще одной проблемой. На этот раз национальная безопасность ни при чем. По международным правилам, публикация генетической информации возможна только с письменного согласия человека. Исследователям осталось оформить необходимые бумаги.

http://www.runewsweek.ru/science/33886/


30 май 2010, 21:44
Профиль
Администратор
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 май 2009, 05:46
Сообщения: 8500
Сообщение Re: Волновая Генетика и ДНК Человека
Новый метод анализа генома поможет лечить наследственные болезни


МОСКВА, 1 июн - РИА Новости. Ученые разработали методику оптического анализа человеческого генома, которая позволит не только быстро и с минимальными затратами расшифровывать ДНК, но и выявлять большие вариации геномов от человека к человеку, сообщается в статье, опубликованной в Proceedings of the National Academy of Sciences во вторник.

Методика может быть использована для изучения генетической изменчивости среди людей и лечения наследственных болезней, полагают исследователи.

Речь идет о вариациях генома, составляющих фрагменты в тысячи, сотни тысяч и миллионы нуклеотидов (единичных "букв" ДНК), которые могут в геномах людей меняться друг с другом местами, повторяться, менять свою длину или быть расположенными в хромосомах в обратном порядке.

Роль подобных вариаций ДНК в человеческом геноме на настоящий момент до конца не выяснена. Тем не менее, согласно некоторым исследованиям, они могут оказывать значительное влияние на работу генов, отвечающих за синтез белковых молекул в человеческом организме.

В своей работе ученые из группы профессора Дэвида Шварца (David Schwartz) из Университета Висконсин-Мэдисон в США, показали, что вариации в этих участках между людьми встречаются очень часто: для четырех разных человек исследователи сумели найти более 4 тысяч таких вариаций. По мнению ученых, изменчивость на этом уровне может объяснить не только уникальность каждого из миллиардов людей, обитающих на Земле, но и выявить генетические причины тех или иных болезней или отклонений в развитии людей.

"Мы полагаем, что существенное количество уникальных фрагментов ДНК, выявленных в геномах всего четырех человек, показывает, как много новых уникальных вариаций человеческого генома остаются еще неоткрытыми", - пишут авторы исследования в своей статье.

До сих пор, изучая изменчивость между людьми на уровне ДНК, ученые концентрировали свое внимание на так называемых "однонуклотидных полиморфизмах" - заменах единичных "букв" ДНК в геноме, состоящем примерно из 3 миллиардов нуклеотидов. Такой подход был обусловлен тем, что существующие методики расшифровки ДНК основаны на "нарезании" хромосом на короткие фрагменты длиной всего несколько сотен "букв", их многократном копировании, расшифровке и дальнейшем составлении общей картины из отдельных коротких фрагментов.

При таком подходе, изменчивость, затрагивающую повторы, удаления и перемещения крупных фрагментов ДНК длиной в тысячи нуклеотидов, изучить просто не представляется возможным. Кроме того, часть генетической информации просто избегает расшифровки.

Для преодоления этой проблемы ученые из группы Шварца разработали новую методику сканирования ДНК, согласно которой хромосомы "разрезаются" на крупные фрагменты в миллионы нуклеотидов, а затем с помощью специальных ферментов закрепляются на подготовленной стеклянной поверхности и разделяются на отрезки. Количество и последовательность таких отрезков в дальнейшем анализируется автоматически с помощью массива специальных микроскопов.

Сравнение полученных данных с уже имеющимися данными о строении человеческого генома и использование больших баз данных позволяет установить генетическую последовательность и изменения, которые данная ДНК несет на себе по сравнению с другими людьми.

"Если с помощью этого метода мы сможем установить генетические причины тех или иных заболеваний, это позволит разработать методы их лечения. Мы с самого начала были нацелены на это", - сказал Брайан Тегу (Brian Teague), соавтор публикации, слова которого приводит пресс-служба Университета.

"Наши системы анализа человеческого генома, при коммерциализации, могут позволить провести анализ человеческого генома за один час и менее чем за 1 тысячу долларов. Это сделает персональную генетическую информацию доступной многим людям", - подытожил Шварц.

http://www.rian.ru/science/20100601/241030344.html


01 июн 2010, 13:21
Профиль
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 178 ]  На страницу Пред.  1 ... 8, 9, 10, 11, 12  След.


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 2


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Перейти:  
cron